Năm 2000, Lee bắt đầu bước chân vào chính trường "dựa trên mối quan hệ của ông với cựu Tổng thống Kim Dae-jung đã hình thành trong khi ông đưa tin về chính trị."[8] Sau khi rời khỏi Dong-a Ilbo, Lee được bầu làm nghị sĩ Quốc hội Hàn Quốc năm 2000 và phục vụ trong bốn nhiệm kỳ.[6] Lee cũng từng là người phát ngôn cho cựu Tổng thống Roh Moo-hyun khi ông đắc cử Tổng thống vào năm 2002.[9]

Ông rời cương vị nghị sĩ Quốc hội vào giữa nhiệm kỳ thứ tư năm 2014 và tranh cử thành công cho chức vụ Thống đốc tỉnh Jeolla Nam.